Diplômée de l’université pour jeunes filles de Kôbe et de l’école d’art et de design d’Ôsaka, Mariko Shinju effectue dans un premier temps principalement des illustrations pour la publicité. En 1994, elle part vivre deux ans aux États-Unis, à New York et Philadelphie. À New York, elle intègre la Parsons School of Design et apprend à réaliser des livres pour enfants. Son premier album est publié en 1998.