Professeur agrégée d'histoire et titulaire d'un Master 2 sur l'usage de la violence au sein de la Résistance (sous la direction d'Olivier Wieviorka), Émeline Vanthuyne a enseigné dans l'enseignement secondaire, de 2006 à 2011. En septembre 2011, elle rejoint la Fondation de la Résistance en tant que responsable des activités pédagogiques. A ce titre, elle a notamment coordonné les brochures nationales du concours national de la Résistance et de la Déportation. Depuis septembre 2013, elle occupe un poste de chargée des projets pédagogiques au sein de la DMPA.